Логотип
Юнионпедия
Связь
Доступно в Google Play
Новый! Скачать Юнионпедия на вашем Android™ устройстве!
Свободно
Более быстрый доступ, чем браузер!
 

STRING

Индекс STRING

STRING (сокр. от Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins) — база данных и веб-ресурс для поиска информации об известных и предсказанных белок-белковых взаимодействиях.

34 отношения: Bioconductor, BLAST, Cytoscape, Ensembl, KEGG, MEDLINE, Protein Data Bank, PubMed, R (язык программирования), SIMAP@home, UniProt, Клеточный цикл, Копенгагенский университет, Прокариоты, Посттрансляционная модификация, Обработка естественного языка, Обмен веществ, Альтернативный сплайсинг, Алгоритм Смита — Ватермана, Секвенирование, Таксономия, Филогенетическое дерево, Цюрихский университет, Эукариоты, Эволюция, Экспрессия генов, Изоформа белка, Белок-белковые взаимодействия, Выравнивание последовательностей, Генная онтология, Дупликация, Дрезденский технический университет, Естественный отбор, Европейская молекулярно-биологическая лаборатория.

Bioconductor

Bioconductor — это масштабный FLOSS-проект, предоставляющий множество отдельных пакетов для биоинформатических исследований.

Новый!!: STRING и Bioconductor · Узнать больше »

BLAST

BLAST (Basic Local Alignment Search Tool — средство поиска основного локального выравнивания) — семейство компьютерных программ, служащих для поиска гомологов белков или нуклеиновых кислот, для которых известна первичная структура (последовательность) или её фрагмент.

Новый!!: STRING и BLAST · Узнать больше »

Cytoscape

Cytoscape (сайтоскейп, в русском биоинформатическом сленге — цитоскейп) — биоинформатическая платформа с открытым исходным кодом, предназначенная для визуализации сетей молекулярных взаимодействий и биологических путей с возможностью использования дополнительных данных, таких как функциональная аннотация, информация об уровне экспрессии генов и пр.

Новый!!: STRING и Cytoscape · Узнать больше »

Ensembl

Логотип http://www.ensembl.org/index.html Ensembl Ensembl — совместный научный проект Европейского института биоинформатики и Института Сенгера.

Новый!!: STRING и Ensembl · Узнать больше »

KEGG

KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes — Киотская энциклопедия генов и геномов) — веб-ресурс, предоставляющий доступ к ряду биологических баз данных и инструментам для анализа биологических и медицинских данных, созданный в 1995 году в рамках проекта «Геном человека».

Новый!!: STRING и KEGG · Узнать больше »

MEDLINE

Medline (MEDlars onLINE) — крупнейшая библиографическая база статей по медицинским наукам, созданная Национальной медицинской библиотекой США (U.S. National Library of Medicine, NLM).

Новый!!: STRING и MEDLINE · Узнать больше »

Protein Data Bank

Protein Data Bank, PDB — банк данных трёхмерных структур белков и нуклеиновых кислот.

Новый!!: STRING и Protein Data Bank · Узнать больше »

PubMed

PubMed — англоязычная текстовая база данных медицинских и биологических публикаций, созданная Национальным центром биотехнологической информации (NCBI) на основе раздела «биотехнология» Национальной медицинской библиотеки США (NLM).

Новый!!: STRING и PubMed · Узнать больше »

R (язык программирования)

R — язык программирования для статистической обработки данных и работы с графикой, а также свободная программная среда вычислений с открытым исходным кодом в рамках проекта GNU.

Новый!!: STRING и R (язык программирования) · Узнать больше »

SIMAP@home

SIMAP — расшифровывается как «Similarity Matrix of Proteins», представляет собой базу данных о сходстве белков, созданную с помощью добровольных вычислений, которая свободно доступна для научных целей.

Новый!!: STRING и SIMAP@home · Узнать больше »

UniProt

безрамки UniProt — открытая база данных последовательностей белков.

Новый!!: STRING и UniProt · Узнать больше »

Клеточный цикл

Кле́точный цикл — период существования клетки от момента её образования путём деления материнской клетки до собственного деления или гибели.

Новый!!: STRING и Клеточный цикл · Узнать больше »

Копенгагенский университет

Копенгагенский университет — один из самых старых университетов и самое большое учебно-исследовательское учреждение в Дании.

Новый!!: STRING и Копенгагенский университет · Узнать больше »

Прокариоты

Прокарио́ты (Procaryota, от πρό «перед» и κάρυον «ядро»), или доя́дерные — одноклеточные живые организмы, не обладающие (в отличие от эукариот) оформленным клеточным ядром и другими внутренними мембранными органоидами (за исключением плоских цистерн у фотосинтезирующих видов, например, у цианобактерий).

Новый!!: STRING и Прокариоты · Узнать больше »

Посттрансляционная модификация

генетического кодаGramatikoff K. in Abgent Catalog (2004-5) p.263, показывающая места возможной посттрансляционной модификации аминокислот Посттрансляционная модификация — это ковалентная химическая модификация белка после его синтеза на рибосоме.

Новый!!: STRING и Посттрансляционная модификация · Узнать больше »

Обработка естественного языка

Обработка естественного языка (Natural Language Processing, NLP) — общее направление искусственного интеллекта и математической лингвистики.

Новый!!: STRING и Обработка естественного языка · Узнать больше »

Обмен веществ

Структура аденозинтрифосфата — главного посредника в энергетическом обмене веществ Метаболи́зм (от μεταβολή «превращение», «изменение») или обме́н веще́ств — набор химических реакций, которые возникают в живом организме для поддержания жизни.

Новый!!: STRING и Обмен веществ · Узнать больше »

Альтернативный сплайсинг

изоформы одного и того же белка Альтернати́вный спла́йсинг — вариант сплайсинга матричных РНК (мРНК), при котором в ходе экспрессии гена на основе одного и того же первичного транскрипта (пре-мРНК) происходит образование нескольких зрелых мРНК.

Новый!!: STRING и Альтернативный сплайсинг · Узнать больше »

Алгоритм Смита — Ватермана

Алгоритм Смита — Ватермана предназначен для получения локального выравнивания последовательностей, то есть для выявления сходных участков двух нуклеотидных или белковых последовательностей.

Новый!!: STRING и Алгоритм Смита — Ватермана · Узнать больше »

Секвенирование

Секвенирование биополимеров (белков и нуклеиновых кислот — ДНК и РНК) — определение их аминокислотной или нуклеотидной последовательности (от sequentum — последовательность).

Новый!!: STRING и Секвенирование · Узнать больше »

Таксономия

Огюстен Декандоль (1778—1841), предложивший в 1813 году термин «таксономия» Таксоно́мия (от τάξις «строй, порядок» + νόμος «закон») — учение о принципах и практике классификации и систематизации сложноорганизованных иерархически соотносящихся сущностей.

Новый!!: STRING и Таксономия · Узнать больше »

Филогенетическое дерево

типов показаны вокруг дерева. Филогенетическое дерево (эволюционное дерево, дерево жизни) — дерево, отражающее эволюционные взаимосвязи между различными видами или другими сущностями, имеющими общего предка.

Новый!!: STRING и Филогенетическое дерево · Узнать больше »

Цюрихский университет

Цюрихский университет (Universität Zürich, сокращенно UZH) — государственный университет в Цюрихе, крупнейший университет Швейцарии, в котором в настоящее время обучается более 26 тыс.

Новый!!: STRING и Цюрихский университет · Узнать больше »

Эукариоты

Наддомен: Биота Домен: Эукариоты Eukaryota Центросома (центриоль) Эукарио́ты (арх. эвкарио́ты; Eukaryota от εὖ- «хорошо» + карион «ядро»), или я́дерные, — домен (надцарство) живых организмов, клетки которых содержат ядро.

Новый!!: STRING и Эукариоты · Узнать больше »

Эволюция

доменов: Бактерии, Археи, Эукариоты Биологическая эволю́ция (от evolutio — «развёртывание») — естественный процесс развития живой природы, сопровождающийся изменением генетического состава популяций, формированием адаптаций, видообразованием и вымиранием видов, преобразованием экосистем и биосферы в целом.

Новый!!: STRING и Эволюция · Узнать больше »

Экспрессия генов

Экспрессия генов — это процесс, в ходе которого наследственная информация от гена (последовательности нуклеотидов ДНК) преобразуется в функциональный продукт — РНК или белок.

Новый!!: STRING и Экспрессия генов · Узнать больше »

Изоформа белка

Изоформа белка — любая из нескольких разных форм одного и того же белка.

Новый!!: STRING и Изоформа белка · Узнать больше »

Белок-белковые взаимодействия

250px Белок-белковые взаимодействия (ББВ) — обладающие высокой специфичностью физические контакты между двумя и более белками.

Новый!!: STRING и Белок-белковые взаимодействия · Узнать больше »

Выравнивание последовательностей

Выравнивание последовательностей — биоинформатический метод, основанный на размещении двух или более последовательностей мономеров ДНК, РНК или белков друг под другом таким образом, чтобы легко увидеть сходные участки в этих последовательностях.

Новый!!: STRING и Выравнивание последовательностей · Узнать больше »

Генная онтология

«Генная онтология» (Gene Ontology, или GO) — биоинформатический проект, посвященный созданию унифицированной терминологии для аннотации генов и генных продуктов всех биологических видов.

Новый!!: STRING и Генная онтология · Узнать больше »

Дупликация

Схема, иллюстрирующая принцип дупликации Дупликация (duplicatio — удвоение) — разновидность хромосомных перестроек, при которой участок хромосомы оказывается удвоенным.

Новый!!: STRING и Дупликация · Узнать больше »

Дрезденский технический университет

Дрезденский технический университет (сам университет использует название Технический университет Дрездена, Technische Universität Dresden, сокр. TUD) — одно из крупнейших высших учебных заведений Дрездена и Саксонии.

Новый!!: STRING и Дрезденский технический университет · Узнать больше »

Естественный отбор

Есте́ственный отбо́р — основной эволюционный процесс, в результате действия которого в популяции увеличивается число особей, обладающих максимальной приспособленностью (наиболее благоприятными признаками), в то время, как количество особей с неблагоприятными признаками уменьшается.

Новый!!: STRING и Естественный отбор · Узнать больше »

Европейская молекулярно-биологическая лаборатория

Здание EMBL в Гейдельберге Гренобле. Европейская молекулярно-биологическая лаборатория (European Molecular Biology Laboratory, EMBL) — фундаментальный научно-исследовательский институт, который финансируется из средств, выделяемых двадцатью странами-участниками и страной-партнером Австралией.

Новый!!: STRING и Европейская молекулярно-биологическая лаборатория · Узнать больше »

ИсходящиеВходящий
Привет! Мы на Facebook сейчас! »