Содержание
22 отношения: C++, GNU General Public License, LGA, Linux, MacOS, Protein Data Bank, Solaris, Windows, World Community Grid, Потенциал Леннард-Джонса, Активный центр фермента, Алгоритм имитации отжига, Рентгеноструктурный анализ, Си (язык программирования), Энергия Гиббса, ЯМР-спектроскопия, Молекулярное моделирование, Метод Монте-Карло, Белки, Виртуальный скрининг, Лицензия Apache, Локальный поиск (оптимизация).
- Молекулярное моделирование
- Программное обеспечение молекулярного моделирования
C++
++ (читается си-плюс-плюс) — компилируемый, статически типизированный язык программирования общего назначения.
Посмотреть AutoDock и C++
GNU General Public License
GNU General Public License (переводят как Универсальная общественная лицензия GNU, Универсальная общедоступная лицензия GNU или Открытое лицензионное соглашение GNU) — лицензия на свободное программное обеспечение, созданная в рамках проекта GNU в 1988 г., по которой автор передаёт программное обеспечение в общественную собственность.
Посмотреть AutoDock и GNU General Public License
LGA
LGA (Land Grid Array, FC-LGA) — тип корпуса микросхем, особенно процессоров, использующий матрицу контактных площадок, расположенную на корпусе микросхемы.
Посмотреть AutoDock и LGA
Linux
Linux (или), Ли́нукс) — семейство Unix-подобных операционных систем на базе ядра Linux, включающих тот или иной набор утилит и программ проекта GNU, и, возможно, другие компоненты.
Посмотреть AutoDock и Linux
MacOS
macOS (изначально была представлена как Mac OS X, в 2012 переименована в OS X, в 2016 переименована в macOS) — проприетарная операционная система производства Apple.
Посмотреть AutoDock и MacOS
Protein Data Bank
Protein Data Bank, PDB — банк данных трёхмерных структур белков и нуклеиновых кислот.
Посмотреть AutoDock и Protein Data Bank
Solaris
Solaris — операционная система, разработанная компанией Sun Microsystems для платформы SPARC, с 2010 года принадлежит вместе с активами Sun корпорации Oracle.
Посмотреть AutoDock и Solaris
Windows
Windows — семейство коммерческих операционных систем (OC) корпорации Microsoft, ориентированных на применение графического интерфейса при управлении.
Посмотреть AutoDock и Windows
World Community Grid
World Community Grid (WCG) — это глобальное сообщество пользователей, которые предоставляют неиспользуемые мощности своих компьютеров для решения сложных заданий.
Посмотреть AutoDock и World Community Grid
Потенциал Леннард-Джонса
Потенциал Леннард-Джонса (потенциал 6-12) — простая модель парного взаимодействия неполярных молекул, описывающая зависимость энергии взаимодействия двух частиц от расстояния между ними.
Посмотреть AutoDock и Потенциал Леннард-Джонса
Активный центр фермента
гексокиназы Активный центр — согласно ИЮПАК, это особая часть молекулы фермента, определяющая её специфичность и каталитическую активность.
Посмотреть AutoDock и Активный центр фермента
Алгоритм имитации отжига
Алгори́тм имита́ции о́тжига (Simulated annealing) — общий алгоритмический метод решения задачи глобальной оптимизации, особенно дискретной и комбинаторной оптимизации.
Посмотреть AutoDock и Алгоритм имитации отжига
Рентгеноструктурный анализ
Рентгенострукту́рный ана́лиз (рентгенодифракционный анализ) — один из дифракционных методов исследования структуры вещества.
Посмотреть AutoDock и Рентгеноструктурный анализ
Си (язык программирования)
Си (C) — компилируемый статически типизированный язык программирования общего назначения, разработанный в 1969—1973 годах сотрудником Bell Labs Деннисом Ритчи как развитие языка Би.
Посмотреть AutoDock и Си (язык программирования)
Энергия Гиббса
Свободная энергия Гиббса (или просто энергия Гиббса, или потенциал Гиббса, или термодинамический потенциал в узком смысле) — это математическая величина, равная изменению внутренней энергии системы в ходе химической реакции; показывающая, какая часть от полной внутренней энергии системы может быть использована для химических превращений или получена в их результате в заданных условиях; и позволяющая установить принципиальную возможность протекания химической реакции в заданных условиях; математически это термодинамический потенциал следующего вида: Энергию Гиббса можно понимать как полную потенциальную химическую энергию системы (кристалла, жидкости) Понятие энергии Гиббса широко используется в термодинамике и химии.
Посмотреть AutoDock и Энергия Гиббса
ЯМР-спектроскопия
Спектроскопи́я я́дерного магни́тного резона́нса, ЯМР-спектроскопия — спектроскопический метод исследования химических объектов, использующий явление ядерного магнитного резонанса.
Посмотреть AutoDock и ЯМР-спектроскопия
Молекулярное моделирование
белков. Молекулярное моделирование (ММ) — собирательное название методов исследования структуры и свойств молекул вычислительными методами с последующей визуализацией результатов, обеспечивающие их трехмерное представления при заданных в расчете условиях.
Посмотреть AutoDock и Молекулярное моделирование
Метод Монте-Карло
Ме́тоды Мо́нте-Ка́рло (ММК) — группа численных методов для изучения случайных процессов.
Посмотреть AutoDock и Метод Монте-Карло
Белки
Белки́ (протеи́ны, полипепти́ды) — высокомолекулярные органические вещества, состоящие из альфа-аминокислот, соединённых в цепочку пептидной связью.
Посмотреть AutoDock и Белки
Виртуальный скрининг
Виртуальный скрининг — это вычислительная процедура, которая включает автоматизированный просмотр базы данных химических соединений и отбор тех из них, для которых прогнозируется наличие желаемых свойств.
Посмотреть AutoDock и Виртуальный скрининг
Лицензия Apache
Лицензия Apache (Apache LicenseИзначально (версии 1.0 и 1.1) лицензия называлась) — лицензия на свободное программное обеспечение Apache Software Foundation.
Посмотреть AutoDock и Лицензия Apache
Локальный поиск (оптимизация)
Алгоритмы локального поиска — группа алгоритмов, в которых поиск ведется только на основании текущего состояния, а ранее пройденные состояния не учитываются и не запоминаются.
Посмотреть AutoDock и Локальный поиск (оптимизация)
См. также
Молекулярное моделирование
- AutoDock
- Folding@home
- Rosetta@home
- Z-матрица
- Метод классической молекулярной динамики
- Молекулярное моделирование
- Молекулярные модели
- Молекулярный докинг
- Цветовая схема моделей Кори — Полинга — Колтуна
Программное обеспечение молекулярного моделирования
- Ascalaph Designer
- AutoDock
- Folding@home
- Jmol
- PyMOL
- QuteMol
- RasMol